MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS315 chromosome

Total Repeats: 33753

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004070	T	6	6	251	256	0 %	100 %	0 %	0 %	21909537
2	NC_004070	T	6	6	310	315	0 %	100 %	0 %	0 %	21909537
3	NC_004070	ATG	2	6	320	325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909537
4	NC_004070	A	7	7	395	401	100 %	0 %	0 %	0 %	21909537
5	NC_004070	CTG	2	6	422	427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21909537
6	NC_004070	GAA	2	6	472	477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909537
7	NC_004070	ATCA	2	8	508	515	50 %	25 %	0 %	25 %	21909537
8	NC_004070	AGC	2	6	524	529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21909537
9	NC_004070	TGC	2	6	624	629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21909537
10	NC_004070	TTA	2	6	712	717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909537
11	NC_004070	AT	3	6	768	773	50 %	50 %	0 %	0 %	21909537
12	NC_004070	TTA	2	6	788	793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909537
13	NC_004070	GAAA	2	8	837	844	75 %	0 %	25 %	0 %	21909537
14	NC_004070	TGA	2	6	873	878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909537
15	NC_004070	A	7	7	895	901	100 %	0 %	0 %	0 %	21909537
16	NC_004070	CT	3	6	904	909	0 %	50 %	0 %	50 %	21909537
17	NC_004070	AAG	2	6	917	922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909537
18	NC_004070	ATA	3	9	950	958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21909537
19	NC_004070	ACAA	2	8	959	966	75 %	0 %	0 %	25 %	21909537
20	NC_004070	ATC	2	6	995	1000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21909537
21	NC_004070	AGA	2	6	1011	1016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909537
22	NC_004070	CCT	2	6	1063	1068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21909537
23	NC_004070	CAAA	2	8	1224	1231	75 %	0 %	0 %	25 %	21909537
24	NC_004070	TGC	2	6	1254	1259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21909537
25	NC_004070	GAA	2	6	1315	1320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909537
26	NC_004070	CTA	2	6	1373	1378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21909537
27	NC_004070	TGG	2	6	1473	1478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21909537
28	NC_004070	TAA	2	6	1509	1514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21909537
29	NC_004070	A	6	6	1569	1574	100 %	0 %	0 %	0 %	21909537
30	NC_004070	ATT	2	6	1768	1773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909538
31	NC_004070	TCA	2	6	1835	1840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21909538
32	NC_004070	GTAA	2	8	1919	1926	50 %	25 %	25 %	0 %	21909538
33	NC_004070	TTA	2	6	1967	1972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909538
34	NC_004070	T	7	7	1981	1987	0 %	100 %	0 %	0 %	21909538
35	NC_004070	ATT	2	6	1994	1999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909538
36	NC_004070	AAC	2	6	2040	2045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21909538
37	NC_004070	GTT	2	6	2051	2056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21909538
38	NC_004070	AAG	2	6	2121	2126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909538
39	NC_004070	ATT	2	6	2161	2166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909538
40	NC_004070	TAT	2	6	2173	2178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909538
41	NC_004070	GTC	2	6	2214	2219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21909538
42	NC_004070	GACT	2	8	2278	2285	25 %	25 %	25 %	25 %	21909538
43	NC_004070	CAG	2	6	2328	2333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21909538
44	NC_004070	GA	3	6	2365	2370	50 %	0 %	50 %	0 %	21909538
45	NC_004070	CAG	2	6	2376	2381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21909538
46	NC_004070	GAT	2	6	2390	2395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909538
47	NC_004070	TTA	2	6	2504	2509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909538
48	NC_004070	GTT	2	6	2531	2536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21909538
49	NC_004070	GGTAA	2	10	2666	2675	40 %	20 %	40 %	0 %	21909538
50	NC_004070	AGTC	2	8	2696	2703	25 %	25 %	25 %	25 %	21909538
51	NC_004070	GAA	2	6	2834	2839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909538
52	NC_004070	AATT	2	8	2850	2857	50 %	50 %	0 %	0 %	21909538
53	NC_004070	TAAG	2	8	2876	2883	50 %	25 %	25 %	0 %	21909538
54	NC_004070	TGAAA	2	10	2976	2985	60 %	20 %	20 %	0 %	21909539
55	NC_004070	A	6	6	2983	2988	100 %	0 %	0 %	0 %	21909539
56	NC_004070	ATG	2	6	3097	3102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909539
57	NC_004070	A	7	7	3129	3135	100 %	0 %	0 %	0 %	21909539
58	NC_004070	CAG	2	6	3490	3495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21909540
59	NC_004070	GCT	2	6	3564	3569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21909540
60	NC_004070	TGGTA	2	10	3602	3611	20 %	40 %	40 %	0 %	21909540
61	NC_004070	A	7	7	3660	3666	100 %	0 %	0 %	0 %	21909540
62	NC_004070	AAAT	2	8	3740	3747	75 %	25 %	0 %	0 %	21909540
63	NC_004070	TGA	3	9	3800	3808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909540
64	NC_004070	TCAA	2	8	3906	3913	50 %	25 %	0 %	25 %	21909540
65	NC_004070	A	6	6	3934	3939	100 %	0 %	0 %	0 %	21909540
66	NC_004070	GTT	2	6	4062	4067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21909540
67	NC_004070	AAC	2	6	4085	4090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21909540
68	NC_004070	CAAA	2	8	4160	4167	75 %	0 %	0 %	25 %	21909540
69	NC_004070	AGT	2	6	4199	4204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909540
70	NC_004070	AGA	3	9	4223	4231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909540
71	NC_004070	AGA	2	6	4259	4264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909540
72	NC_004070	AGC	2	6	4316	4321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21909540
73	NC_004070	ATC	2	6	4324	4329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21909540
74	NC_004070	CAG	2	6	4354	4359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21909540
75	NC_004070	GCT	2	6	4413	4418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21909540
76	NC_004070	TAT	2	6	4421	4426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909540
77	NC_004070	ATG	2	6	4474	4479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909540
78	NC_004070	AAG	2	6	4513	4518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909540
79	NC_004070	GAA	2	6	4533	4538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909540
80	NC_004070	TGT	2	6	4550	4555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21909540
81	NC_004070	CAT	2	6	4568	4573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21909540
82	NC_004070	TTG	2	6	4678	4683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21909541
83	NC_004070	A	6	6	4711	4716	100 %	0 %	0 %	0 %	21909541
84	NC_004070	GAT	2	6	4782	4787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909541
85	NC_004070	TTA	2	6	4819	4824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909541
86	NC_004070	CTA	2	6	4852	4857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21909541
87	NC_004070	AAT	2	6	4866	4871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21909541
88	NC_004070	CTA	2	6	4901	4906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21909541
89	NC_004070	ATG	2	6	4939	4944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909541
90	NC_004070	TTACGT	2	12	4968	4979	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	21909541
91	NC_004070	CAG	2	6	4990	4995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21909541
92	NC_004070	GAC	2	6	5071	5076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21909541
93	NC_004070	TTA	2	6	5095	5100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909541
94	NC_004070	ATA	2	6	5131	5136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21909541
95	NC_004070	TTTA	2	8	5182	5189	25 %	75 %	0 %	0 %	21909541
96	NC_004070	A	6	6	5206	5211	100 %	0 %	0 %	0 %	21909541
97	NC_004070	GAT	2	6	5372	5377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909542
98	NC_004070	A	9	9	5379	5387	100 %	0 %	0 %	0 %	21909542
99	NC_004070	TGA	2	6	5452	5457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909542
100	NC_004070	T	6	6	5474	5479	0 %	100 %	0 %	0 %	21909542
101	NC_004070	TGA	2	6	5703	5708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909542
102	NC_004070	T	6	6	5819	5824	0 %	100 %	0 %	0 %	21909542
103	NC_004070	GAT	2	6	5828	5833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909542
104	NC_004070	AAC	2	6	5880	5885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21909542
105	NC_004070	TTA	2	6	5898	5903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909542
106	NC_004070	GAT	2	6	5987	5992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909542
107	NC_004070	A	6	6	5993	5998	100 %	0 %	0 %	0 %	21909542
108	NC_004070	AGA	2	6	6007	6012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909542
109	NC_004070	A	6	6	6028	6033	100 %	0 %	0 %	0 %	21909542
110	NC_004070	ATT	2	6	6070	6075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909542
111	NC_004070	ATT	2	6	6094	6099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909542
112	NC_004070	T	6	6	6128	6133	0 %	100 %	0 %	0 %	21909542
113	NC_004070	GAT	2	6	6134	6139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909542
114	NC_004070	GATTT	2	10	6168	6177	20 %	60 %	20 %	0 %	21909542
115	NC_004070	AGA	2	6	6199	6204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909542
116	NC_004070	ACT	2	6	6237	6242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21909542
117	NC_004070	CTT	2	6	6286	6291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21909542
118	NC_004070	T	6	6	6368	6373	0 %	100 %	0 %	0 %	21909542
119	NC_004070	TTGA	2	8	6389	6396	25 %	50 %	25 %	0 %	21909542
120	NC_004070	A	7	7	6414	6420	100 %	0 %	0 %	0 %	21909542
121	NC_004070	AAC	2	6	6424	6429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21909542
122	NC_004070	ACGA	2	8	6462	6469	50 %	0 %	25 %	25 %	21909542
123	NC_004070	CCTT	2	8	6502	6509	0 %	50 %	0 %	50 %	21909542
124	NC_004070	AGTG	2	8	6511	6518	25 %	25 %	50 %	0 %	21909542
125	NC_004070	TGA	2	6	6586	6591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909542
126	NC_004070	ACG	2	6	6640	6645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21909542
127	NC_004070	GATTCA	2	12	6763	6774	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	21909542
128	NC_004070	TAG	2	6	6847	6852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909542
129	NC_004070	CTG	2	6	6870	6875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21909542
130	NC_004070	TAA	2	6	6895	6900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21909542
131	NC_004070	ATG	2	6	6906	6911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909542
132	NC_004070	TGA	2	6	6964	6969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909542
133	NC_004070	AAG	2	6	6991	6996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909542
134	NC_004070	ATTTTC	2	12	7009	7020	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	21909542
135	NC_004070	GAT	2	6	7025	7030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909542
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137	NC_004070	TGA	3	9	7048	7056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909542
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272	NC_004070	TA	5	10	12846	12855	50 %	50 %	0 %	0 %	21909548
273	NC_004070	TGA	2	6	12857	12862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909548
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277	NC_004070	ATTA	2	8	12939	12946	50 %	50 %	0 %	0 %	21909548
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